Українсько-естонське співробітництво в галузі освіти і науки характеризується високою динамікою та включає в себе низку обопільно вигідних проектів.
У рамках Меморандуму про співробітництво між Дипломатичною академією України при МЗС України та Естонською школою дипломатії (ЕШД) щороку реалізується програма десятимісячного навчання українських студентів в Естонській школі дипломатії на основі шведсько-естонського проекту. За ініціативи Посольства України, Естонська школа дипломатії спільно з МЗС ЕР розробили довгострокову Програму підготовки українських фахівців з питань ЄС.
Протягом академічного періоду 2019/2021 років в Естонії проходили навчання 236 студенти з України:
У Тартуському університеті 103 особи;
У Талліннському технічному університеті 81 особа;
У Євроакадемії 15 осіб;
У Талліннському університеті 11 осіб;
В інших вищих учбових закладах (Естонська бізнес школа, Естонська Академія мистецтв, Університеті природничих наук) 26 осіб.
Активний діалог сторони проводять у галузі впровадження інклюзивної освіти, питань розробки цільових програм навчання для дітей з особливими освітніми потребами відповідно до різних нозологій.
Важливу роль відіграє допомога естонського освітнього фонду “INNOVE”, який надає допомогу регіонам України, зокрема Хмельниччини, Київщини, Чернівців, м.Дніпро, Донецькій та Луганській областям у розбудові професійно-технічної освіти в Україні.
Україна та Естонія мають хорошу динаміку співробітництва у галузі науки та освіти. Найбільш цікавим для України є досвід Естонії в організації професійно-технічної освіти, інклюзивної освіти, розвитку ІТ-технологій та е-врядування.
Українські науковці працюють у низці ВУЗів Естонії, зокрема в Талліннському технічному університеті та Тартуському університеті, де беруть участь у розробці низки наукових продуктів, зокрема у сфері цифрових технологій.
Нажаль агресія рф проти України негативно вплинула на темпи розвитку українсько-естонського науково-технічного співробітництва та співпраці в освітній сфері. Позитивну динаміку розвитку цих видів співробітництва буде відновлено після завершення воєнних дій та відновлення територіальної цілісності України.